Anfang der 1980er Jahre entdeckten der damalige Pastor der Kirchengemeinde St. Johannis zu Neuengamme, Jürgen Köhler, und einige Gemeindeglieder die Auseinandersetzung mit dem KZ Neuengamme für sich als Aufgabe. Mit großem ehrenamtlichen Engagement konnte dieser Arbeitsbereich in den folgenden Jahren ausgebaut werden.

1992 richtete der Kirchenkreis Alt-Hamburg der Nordelbischen Evangelisch-Lutherischen Kirche eine eigene Pfarrstelle mit dem Schwerpunkt „Kirchliche Gedenkstättenarbeit" ein. Das neue Pfarramt wurde bis 1998 von seinem Initiator Pastor J. Köhler geleitet.

Von 1999 bis 2012 übernahm Pastor Veit Buttler diese Aufgabe. Sein Nachfolger wurde im Februar 2012 Pastor Hanno Billerbeck. Seit Sommer 2024 ist Dr. Martin Gedenkstättenpastor.